Fabuła Clash II osadzona będzie w mrocznym świecie na kontynencie zwanym Karkhan. Od lat toczą się tam boje pomiędzy najeźdźcami noszącymi znaki Jednego Boga, zwącymi samych siebie Czystowiercami, a ludnością, która od pokoleń zamieszkuje pełne magii ziemie kontynentu, nazywaną pogardliwie Innowiercami. Narastający konflikt zabierze nas ponownie w centrum bitew pomiędzy obiema frakcjami i nie tylko. Podczas rozgrywki będziemy mogli prowadzić tubylcze ludy, niezgadzające się z dogmatami nowej wiary i buntujące przeciw obcej kulturze lub najeźdźców, pragnących rozciągać swe wpływy na cały kontynent.